La botánica pura estudia las plantas desde un punto de vista puramente biológico centrándose en su morfología. Consta de tres niveles:
Cultivo de una vid (vitis vinifera) in vitro.Organografía
Histología vegetal
Citología vegetal
Diferentes partes de esta rama de la botánica son:
La Fisiología vegetal, que estudia los diferentes procesos que se dan en las plantas.
La Genética vegetal, que estudia los sistemas reguladores de su herencia y la transmisión de caracteres y atributos.
La Sistemática vegetal, que estudia su diversidad, así como su relación biológica (filogenia), según dos divisiones:
Criptógamas (plantas sin flor)
Fanerógamas (con flor)
Incluido en este apartado sistemático se encuentra la ficología ( algas), micología (estudio de los hongos), pteridología (estudio de los helechos) y la fanerogamia.
La Geobotánica, que estudia las plantas en relación con su medioambiente.
La Paleobotánica, que estudia los restos fósiles vegetales.